哲學系教學體系包括本科生教學、碩士生教學、博生師生教學三個層次，基本特點是:

(1)以哲學一級學科為平臺，三個層次貫通，按照哲學8個二級學科設置主干課程和選修課程，構成了層次完備、覆蓋全面的哲學學科教學體系;

(2)堅持人文基礎教育和哲學專業教育相結合、專業理論學習和科研能力培養相結合、哲學專業學術人才培養和高層次社會應用型人才培養相結合;

(3)充分利用哲學系和清華大學的資源，設置了常規性的國際交換培養和聯合培養的學生培養機制。除邀請國際著名學者來系講座、授課外，哲學系每年均擇優選派多名各層次學生到國外學習，使本系學生在知識和素質兩方面都能得到國際化的培養。

(4)本學科三個層次，均招收大陸境外留學生(含港、澳、臺)，實現了生源的全國化和國際化。